Objetivo. - Determinar la frecuencia y mortalidad de la coinfección por patógenos respiratorios virales detectados mediante métodos moleculares y su asociación con desenlaces desfavorables en pacientes hospitalizados por COVID-19. Métodos: Se realiza un estudio tipo observacional y analítico, longitudinal analítico de cohorte prospectiva que analizará muestras obtenidas de esputo o lavado bronquial obtenidas de pacientes hospitalizados con sospecha de COVID-19. PALABRAS CLAVES: COVID-19, coinfección, patogeno respiratorio OBJETIVO GENERAL. Evaluar la frecuencia de coinfección con patógenos respiratorios bacterianos y virales detectados mediante métodos moleculares y su asociación con desenlaces desfavorables incluyendo la necesidad de ventilación mecánica y muerte en pacientes hospitalizados por COVID-19. OBJETIVOS ESPECÍFICOS: • Determinar la frecuencia de coinfección con patógenos respiratorios bacterianos y virales detectados mediante métodos de biología molecular en pacientes hospitalizados por COVID-19. • Determinar la frecuencia de desenlaces desfavorables en pacientes hospitalizados en la unidad de atención de COVID-19 en el Hospital Nacional Hipólito Unanue. • Evaluar la asociación cruda entre cada uno de los patógenos y la presencia de cualquier patógeno viral o bacteriano evaluados con la presencia de desenlaces desfavorables. • Evaluar la asociación ajustada entre cada uno de los patógenos y la presencia de cualquier patógeno viral o bacteriano evaluados con la presencia de desenlaces desfavorables. Materiales y métodos Se realizará un método empírico, de observación y analítico. Estudio empírico de observación, longitudinal analítico de cohorte prospectiva que analizará muestras de esputo o lavado bronquial obtenidas de pacientes hospitalizados con sospecha de COVID-19 en el Hospital Nacional Hipólito Unanue entre abril y octubre 2020, para evaluar la coinfección de patógenos respiratorios bacterianos y virales y su asociación con mortalidad y desenlaces desfavorables. Se traajará con pacientes hospitalizados con sospecha de COVID-19 en el Hospital Nacional Hipólito Unanue entre abril y octubre 2020. Se considerará como desenlace primario la mortalidad. Como desenlaces secundarios se incluirán la necesidad de ventilación mecánica, ingreso a unidad de cuidados intensivos, estancia hospitalaria y el indicador combinado de mortalidad e ingreso a cuidados intensivos. Las variables independientes serán las coinfecciones virales o bacterianas detectados mediante FilmArray.Se analizarán muestras de esputo o lavado bronquial obtenidas de pacientes hospitalizados con sospecha de COVID-19 en el Hospital Nacional Hipólito Unanue entre abril y octubre 2020. Las muestras de esputo y lavado bronco alveolar serán colocadas en tubos de polipropileno estériles de 5mL y transportadas al Instituto Nacional de Salud, manteniendo la cadena de frio (2-8°C), para la identificación de agentes etiológicos virales y bacterianos mediante la plataforma molecular FilmArray. Se analizarán 33 patógenos respiratorios incluyendo 18 bacterias, 9 virus y 7 genes asociados a resistencia antimicrobiana. Los pacientes positivos para COVID-19 serán confirmados por el método molecular RT-PCR en el Instituto Nacional de Salud. Los resultados del diagnóstico confirmatorio serán obtenidos a través del NetLab2 en el Hospital Nacional Hipólito Unanue. La información de los desenlaces se obtendrá a partir de la revisión de historias clínicas del hospital. Como análisis secundario se comparará la frecuencia de infección bacteriana y viral en pacientes con sospecha clínica hospitalizados en quienes se haya realizado el hisopado, pero con resultado negativo a coronavirus (30 muestras)