ANÁLISIS METABOLÓMICO DE FOCOS HEPÁTICOS SIN PRECEDENTES DE ALTERACIÓN CELULAR EN CARCINOMA HEPATOCELULAR (HCC) EN LA POBLACIÓN PERUANA

Date: Miércoles, 24 Junio 2020 12:25
RESUMEN El equipo de investigación de Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN) y el Instituto de Investigación para el Desarrollo (IRD), ha descrito en los últimos años más de una característica del cáncer de hígado en el Perú. Este cáncer posee una inusual epidemiología clínica en el país, presentándose en dos poblaciones de pacientes de alrededor de los 25 y 64 años, respectivamente. Además, el cáncer de hígado en la población peruana muestra un patrón único de mutaciones somáticas. Además, el equipo de investigación INEN-IRD ha encontrado características singulares en tejido no canceroso (focos) de pacientes peruanos con cáncer de hígado sin cirrosis. Las pistas histológicas indican que estos focos están asociados con la historia natural de la enfermedad. Este proyecto facilitará la búsqueda de nuevos marcadores de diagnóstico y pronóstico para el cáncer de hígado y permitirá la determinación de terapias efectivas contra el HCC. OBJETIVOS Evaluar los perfiles metabolómicos de pacientes peruanos con carcinoma hepatocelular (HCC). Seleccionar pacientes peruanos con carcinoma hepatocelular (HCC) y Coleccionar muestras de tejido tumoral y no tumoral de pacientes. Crioconservar tejidos tumorales y no tumorales de pacientes peruanos con carcinoma hepatocelular y Seleccionar muestras para Microdisección Láser MATERIALES Y MÉTODOS Las personas sospechosas de tener neoplasia maligna del hígado serán manejadas a través del Departamento de Cirugía Abdominal del INEN. Las muestras de tejido tumoral y no tumoral se colocan en bolsas estériles de manera independiente. Al llegar al laboratorio de conservación, la muestra será codificada manteniendo el anominato del paciente. Posteriormente, el tejido será procesado en secciones de 0.5 cm (colocadas en crioviales) y en una sección de 1 cm de largo (colocada en criomolde con OCT, optimal cryopreservation temperature). Al terminar el procesamiento de la muestra, tanto los crioviales como los criomoldes se colocarán en nitrógeno líquido y una vez estén congelados se procederán a almacenar a -150°C. Al terminar el almacenamiento de la muestra, se procederán a hacer el registro en la base de datos del laboratorio, en donde se almacenará el registro de cada muestra guardada. El estudio metabolómico de los focos hepáticos identificados serán aislados mediante el sistema de Microdisección Láser. Nuestro equipo cuenta con acceso a instrumentos de última generación dedicados a este enfoque,UHPLC-DADCAD- LTQ-Orbitrap XL. La combinación de todos estos detectores aporta información útil con respecto a los datos cualitativos [detector de matriz de diodos y MS (DAD)] y datos semicuantitativos [detector CAD] de los extractos analizados. Para obtener una visión global de todo el metaboloma,se realizará un enfoque analítico multiplex. Todos estos datos se recopilarán y analizarán con MS-DIAL para la deconvolución de picos y extracción de patrones de fragmentación MS/MS. La máxima anotación se realizará utilizando el software MS-FINDER para calcular la fórmula molecular y comparar los patrones de fragmentación con los fósforos in silico. Dado que la señal ESI-MS no refleja el estado cuantitativo real de un compuesto dado, los cromatogramas CAD se deconvolucionarán usando speaq y se correlacionarán con las señales MS usando paquetes MScombine en R. Para expandir la anotación del metaboloma,se creará una red de similitud de spectral MS. Finalmente,las vías impactadas se resaltarán utilizando el módulo de metaboAnalyst, que conducirá a resaltar e identificar los principales biomarcadores y vías implicados en HCC, además se realizará un análisis de datos multivariado para alimentar un modelo de estratificación de pacientes.
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Id_row:
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Nu_investigacion:
1324
Autores:
ELOY FRANCISCO RUIZ FIGUEROA, LUIS MANUEL TAXA ROJAS, SANDRO ANGEL ANIBAL CASAVILCA ZAMBRANO, STÉPHANE BERTANI
Palabras_clave:
CANCER CARE FACILITIES, CARCINOGENESIS, LIVER DISEASES, METABOLOMICS, MICRODISSECTION
Url:
https://www.ins.gob.pe/prisa/ver_investigacion.aspx?5733434E-1409-413A-A851-EC20B745A152