Introducción: El curso impredecible de la COVID-19, un síndrome respiratorio agudo severo (SARS) causado por el betacoronavirus (CoV) SARS-CoV-2, varía desde individuos asintomáticos hasta falla multiorgánica fatal. Objetivo: Identificar las posibles variantes genéticas asociadas a defectos inmunitarios del huésped contra el SARS-CoV2 en pacientes hospitalizados menores de 18 años con COVID-19 grave atendidos en el Instituto Nacional de Salud del Niño. Metodología: Se realizará un estudio analítico, de corte transversal y prospectivo. Estará conformado por todos los pacientes menores de 18 años con COVID-19 grave que acepten participar del estudio de investigación. La muestra será por conveniencia, durante el periodo 2020-2022. Para garantizar la identificación y el seguimiento correctos de los datos genómicos, todos los análisis genómicos se realizarán a través de la aplicación Emedgene. Resultados esperados: Describir las variantes genéticas de pacientes infectados por el virus SARS-CoV2 causante de la COVID-19, asociados a enfermedad severa.