“ARQUITECTURA GENÉTICA DE COVID-19 EN LA POBLACIÓN PERUANA: GWAS COMO ESTRATEGIA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE BIOMARCADORES DE PROGRESIÓN A SINTOMATOLOGÍA GRAVE E IDENTIFICACIÓN DE NUEVOS BLANCOS TERAPÉUTICOS”

Fecha de registro: Jueves, 01 Diciembre 2022 10:37
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RESUMEN EJECUTIVO Justificación: La evolución clínica del Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS) asociado a la infección por el SARS-CoV2 es crítica y no se conocen biomarcadores asociados con su progresión. Recientemente, se ha destacado la importancia de los receptores humanos ACE2 y de la serina proteasa TMPRSS2 por ser puertas de ingreso del virus hacia su célula blanco, así como a la tormenta de citoquinas como desencadenante de una inflamación generalizada pudiendo ocasionar muerte del paciente. Estos datos resaltan la importancia de caracterizar la arquitectura genética (genoma completo) de la población peruana ante esta pandemia que ayude a identificar grupos poblacionales de riesgo a desarrollar síntomas severos y por tanto contribuir a políticas de salud orientadas a directrices de prevención. Adicionalmente en la emergencia actual, la caracterización del genoma peruano también puede servir de herramienta para la búsqueda de nuevos tratamientos, la estrategia farmacológica más viable, rápida y realista en el contexto de países en desarrollo y de crisis económica venidera, es el reposicionamiento de fármacos. Objetivo de investigación: i) Identificar variantes genómicas (barrido genómico, GWAS) del humano asociadas con cuadro clínico de severidad de COVID-19 (moderado, severo y severo -UCI) y que puedas ser blancos terapéuticos que sugieran reposicionamiento de fármacos Metodología: Diseño: El enrolamiento de los participantes y colecta de data epidemiológica se realizará usando un diseño prospectivo y el análisis de asociación genómica se realizará usando un diseño caso-control anidado. Los casos serán los pacientes con sintomatología de moderada, a severa a grave que ingresarán a hospitalización en uno de los nosocomios participantes del estudio y los controles son aquellos pacientes con sintomatología leve que recibirán el alta en casa y no requirieron hospitalización hasta ser dados de alta. Se tomará una muestra de sangre venosa para el análisis genético e hisopado nasofaríngeo para el análisis de expresión de genes del paciente. Adicionalmente, se medirán los títulos de anticuerpos y virus como factores de riesgo de severidad. Se tomara muestras de saliva para el diagnóstico y el monitoreo de la carga viral de SARS-CoV-2. Se hará colecta de información de la ficha epidemiológica del MINSA y de la historia clínica de cada participante. Métodos: El ADN y ARN humano será extraído usando kits comerciales. Realizaremos un análisis de asociación genómicas (genome-wide association study, GWAS) de la gravedad de la progresión clínica de COVID-19, medida por un score a ser creado que considere tipo de internación (normal o en UCI), necesidad o no de respirador y resultado de rayos X, controlando el efecto de edad, sexo, geografía, IMC, comorbilidades, principalmente. Analizaremos el genoma completo que incluye a más de 25,000 genes e identificaremos regiones del ADN que puedan generar susceptibilidad genética a enfermedad severa por SARS-Cov-2. Serán realizados tests de asociación estadística para las variantes y para corregir por comparaciones múltiples, se considerará un cut-off de significación de 10-5. Las variantes con asociación significativa serán anotadas usando herramientas bioinformáticas consultando diferentes bancos de datos biológicos, en particular el Drug-Gene Interaction Database (DGIdb, 2017) para la identificación de fármacos que actúan sobre los targets encontrados en este estudio. Palabras clave: COVID-19, severidad, genética humana
Id_row:
2D43F1E1-E9FE-4E8A-9B88-42F7EA8A27AC
Nu_investigacion:
2946
Autores:
ANDRES GUILLERMO LESCANO GUEVARA, ARTURO ALBERTO MAMANI SALCE, EDUARDO MARTIN TARAZONA SANTOS, EVA MARISOL MAMANI PARIONA, MEDDLY LESLYE SANTOLALLA ROBLES
Palabras_clave:
COVID-19, EPIDEMIOLOGY, GENETIC ASSOCIATION STUDIES, PERU
Url:
https://www.ins.gob.pe/prisa/ver_investigacion.aspx?2D43F1E1-E9FE-4E8A-9B88-42F7EA8A27AC

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