USING THE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS GENOME TO PREDICT TUBERCULOSIS PATHOLOGY, DRUG RESISTANCE ACQUISITION AND IDENTIFY COMMUNITY TRANSMISSION SITES

Fecha de registro: Jueves, 12 Enero 2023 21:14
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A nivel mundial, la tuberculosis (TB) es la principal causa de muerte por un solo agente infeccioso con más de 6 millones de nuevos casos de enfermedad informados en 2016 y 1.700 millones de personas con infección latente en todo el mundo. La terapia de observación directa (DOT) ha ayudado a reducir la tasa de incidencia de la enfermedad tuberculosa, pero solo en un 2 % por año. Esto hace que sea imperativo diseñar e implementar medidas alternativas de control de la tuberculosis para controlar la propagación de la enfermedad. Los objetivos de este estudio son: Combinar datos de secuenciación del genoma del patógeno de la tuberculosis (TB) a nivel de población con datos radiológicos y determinar la firma genómica bacteriana de la patología en la tuberculosis. Utilizar la secuenciación del genoma completo del patógeno a nivel de población junto con los datos de rastreo GPS de teléfonos inteligentes y lo último en análisis de mapeo de ecología espacial para descubrir nuevos sitios de transmisión de tuberculosis. Usar un conjunto único de >9000 cepas bacterianas recolectadas en Perú a nivel de población durante 20 años para inferir filogenéticamente qué antecedentes genéticos están asociados con la adquisición de resistencia a los medicamentos; luego confirme estos hallazgos en el laboratorio y en una colección similar de conjuntos de datos moldavos de >3000 cepas. Objetivos Objetivo 1: Combinar los datos del secuenciamiento del genoma del patógeno de la tuberculosis (TB) a nivel de población con datos radiológicos y determinar la firma genómica bacteriana de la patología en la tuberculosis. Objetivo 2: Utilizar el secuenciamiento del genoma completo de patógenos a nivel de población junto con los datos de rastreo GPS de teléfonos inteligentes y lo último en análisis de mapas de ecología espacial para descubrir nuevos sitios de transmisión de tuberculosis. Objetivo 3: Utilizar un conjunto único > de 9000 cepas bacterianas recolectadas en Perú a nivel de población durante 20 años para inferir filogenéticamente qué antecedentes genéticos están asociados con la adquisición de resistencia a los medicamentos; luego confirmar estos hallazgos en el laboratorio y en un conjunto de datos similar de Moldavia de más de 3000 cepas.Los casos nuevos para todos los objetivos del estudio se identificarán en el momento del diagnóstico a través de los laboratorios regionales de referencia en Lima Sur y Callao
Id_row:
6A962BC2-BCDE-4C0D-974E-90D88DAAD742
Nu_investigacion:
2977
Autores:
MIRKO JUAN ZIMIC PERALTA
Palabras_clave:
DIAGNOSIS, SEQUENCE ANALYSIS, TUBERCULOSIS
Url:
https://www.ins.gob.pe/prisa/ver_investigacion.aspx?6A962BC2-BCDE-4C0D-974E-90D88DAAD742

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