Objetivo: Determinar el rol del Ct derivado de RT-PCR obtenido de Hisopados nasofaríngeos como factor pronóstico para fallecimiento, medido al momento de su admisión a emergencia en pacientes con infección de SARS-CoV-2 de un hospital de referencia regional de ESsalud del Cusco. Metodología: Se llevará a cabo un estudio observacional analítico de cohorte retrospectiva. Para el estudio se tomará los datos extraídos por la unidad de epidemiología de los pacientes diagnosticados con infección por COVID-19 del hospital Nacional Adolfo Guevara Velasco de Cusco en el periodo agosto 2021 a julio 2022. Para la determinación del punto de corte del valor de Ct se realizará mediante la curva ROC para los dos desenlaces para predecir la ocurrencia de fallecimiento o mortalidad. Se utilizará el índice de Youden para determinar el mejor punto de corte en cada una de las curvas. Se construirá un modelo de riesgos proporcionales de Cox para comparar los riesgos acumulativos de intubación y muerte. Se calcularán Hazard ratios (HR) crudos y ajustados con sus respectivos intervalos de confianza (IC) al 95%, se identificarán los factores de riesgo que se asocien con la mortalidad hospitalaria y la intubación mediante modelos de regresión logística univariante. Todas las variables que se asociaron estadísticamente significativamente con cada resultado se introdujeron en modelos de regresión logística multivariante separados. Se calcularán los Hazard ratios ajustados de mortalidad e intubación para cada una de estas variables con intervalos de confianza (IC) del 95%. Los análisis se realizaron utilizando Stata, versión 17.0.