Introducción: El síndrome de Burnout (SBO) es un fenómeno ampliamente estudiado que afecta a estudiantes, pero en nuestro medio aún no hay reportes longitudinales acerca de su tendencia en estudiantes de medicina humana. Objetivo: El objetivo del estudio fue determinar la tendencia del SBO y su prevalencia en estudiantes de medicina a lo largo de un semestre académico y medir la variación de las tres dimensiones que lo componen a lo largo de este período. Métodos: Se realizó un diseño de estudio longitudinal, observacional y descriptivo, donde se midió las dimensiones del SBO con el Maslach Burnout Inventory - Student Survey (MBI-SS) y en estudiantes de medicina en tres periodos distintos del semestre académico y de otras variables relacionadas. Se aplicó pruebas de normalidad, de análisis de varianza y chi-cuadrado usando un valor de p<0,05 Resultados: La prevalencia del SBO fue de 8,0%, 12,7% y 16,2% en el primer, segundo y tercer periodo, respectivamente. Hubo una tendencia significativa entre el primer y tercer periodo (p =0,019). El promedio de edad fue de 20,4 años. Las variables relacionadas que tenían una asociación fueron edad (p=0,011) y año de estudios (p=0,039) Conclusión: La prevalencia del SBO al inicio del semestre académico se duplica al finalizar con una tendencia significativa. Las dimensiones del SBO que varían durante el periodo académico son el agotamiento emocional y el cinismo. Las variables más asociadas fueron el año de estudios y la edad.